כפרי הנוער של הסוכנות היהודית מאפשרים לחניכים ללמוד, להעשיר את עולמם ולהתפתח, באמצעות בניית תוכנית אישית המותאמת לכל חניך - מסלולי לימוד אישיים, הקניית כישורי חיים, וליווי אישי
כפר הנוער בן יקיר ממוקם בעמק חפר, ומעניק בית חם וסביבה חינוכית-טיפולית לכ-130 בני נוער בגילאי 12–18 (כיתות ז'-י"ב) הנמצאים במצבי סיכון ומצוקה.

כפר הנוער קריית יערים נמצא באיזור ירושלים, ומאכלס כ-100 נערים ונערות מכיתות ט – י"ב. כפר הנוער קריית נערים הוא מכפרי הנוער המובילים בישראל ומאופיין בקבוצות וכיתות קטנות של עד 16 חניכים, מציע ליווי צמוד של עובדת סוציאלית לכל קבוצה, ומתקיימות בו פעולות עשירות ומגוונות עבור החניכים.

כפר הנוער הדסה נעורים שוכן על מצוק המשקיף לים התיכון ליד בית ינאי, ומאכלס כ-500 תלמידים ותלמידות מכיתות ט'- י"ב. הכפר שהוקם בשנת 1948 על ידי ארגון הדסה והסוכנות היהודית פועל כעמותה ללא מטרת רווח המעניקה בית בטוח ומקדם לבני נוער מרחבי הארץ והעולם.

כפר הנוער נווה מדבר ניצנה הוא תיכון בתנאי פנימייה ומיועד לחניכים מהחברה הבדואית בכיתות ט’-י”ב. החניכים מגיעים מכל רחבי הנגב, , מיישובי הקבע ומהיישובים הבלתי מוכרים. צוות הכפר מעורב ומורכב מאנשי חינוך ממוצא בדואי, יהודי וערבי-צפוני
